Das ist Ansichtssache.
Allgemein hat sich wohl S.Q.L. durchgesetzt - jeder Buchstabe wird einzeln ausgesprochen, also "Es-Kju-El" (engl.) oder "Es-Ku-El" (dt.). Gelegentlich findet sich auch die Aussprache "Sequel" ("Siekwel").
Andrew ist der Meinung, daß "Sequel-Zoo" besser klingt.
Einer der Gründe, warum man S.Q.L. sagt, besteht wohl darin, daß es ebenfalls ein IBM-Produkt SEQUEL gab. Aus rechtliche Gründen benannte man dann das Nachfolgeprodukt SEQUEL/2 in SQL um.